Можно ли использовать счет-фактуру и УПД одновременно и не препятствует ли одновременное использование двух документов принятию НДС к вычету 

Включение в счет-фактуру наряду с услугами, подлежащими налогообложению, услуг, которые освобождены от налогообложения на основании ст. 149 НК РФ, не влечет за собой признание такого счета-фактуры составленным неверно. Организация может использовать приведенную в Письме ФНС России от 21.10.2013 N ММВ-20-3/96@ «Об отсутствии налоговых рисков при применении налогоплательщиками первичного учетного документа, составленного на основе формы счета-фактуры» форму документа, объединяющего в себе информацию счета-фактуры и первичного учетного документа, самостоятельно дополняя его показателями, в том числе необходимыми для выполнения требований ст. 169 НК РФ и Постановления Правительства РФ от 26.12.2011 N 1137 «О формах и правилах заполнения (ведения) документов, применяемых при расчетах по налогу на добавленную стоимость».

Документ: Вопрос: …При формировании счетов-фактур в них попадают услуги, не облагаемые НДС. Признается ли такой счет-фактура неверно оформленным? Можно ли использовать универсальный передаточный документ (УПД) и счет-фактуру одновременно, если одни клиенты хотят видеть УПД, а другие — счет-фактуру и акт выполненных работ? («Налогообложение, учет и отчетность в коммерческом банке», 2019, N 10) {КонсультантПлюс}